Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD1Q8N815 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms