Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LcorQ6ZPI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms