Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trak1Q6PD31 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms