Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms