Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm5aQ3UXZ9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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