Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms