Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pkp1P97350 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pkp1P97350 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pkp1P97350 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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