Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfbiP82198 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms