Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms