Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P58686 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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P58686 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P58686 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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