Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gabrb1P50571 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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