Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprkP35822 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprkP35822 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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