Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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PdgfraP26618 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PdgfraP26618 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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