Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klra1P20937 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms