Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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