Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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CcnkO88874 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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CcnkO88874 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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CcnkO88874 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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