Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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