Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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