Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SacsQ9JLC8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SacsQ9JLC8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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