Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Snx8Q8CFD4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx8Q8CFD4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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