Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Amigo3Q8C2S7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amigo3Q8C2S7 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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