Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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