Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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