Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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