Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms