Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms