Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2bQ01097 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2bQ01097 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms