Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SgcdP82347 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SgcdP82347 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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SgcdP82347 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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SgcdP82347 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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