Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PolgP54099 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PolgP54099 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PolgP54099 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PolgP54099 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms