Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tnfsf9P41274 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tnfsf9P41274 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms