Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata3P23772 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms