Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cxcl2P10889 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms