Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-Ab1P01921 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms