Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Smad6O35182 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smad6O35182 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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