Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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