Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm379J3QQ19 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm379J3QQ19 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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