Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf217D3YYI7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rnf217D3YYI7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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