Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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AmfrQ9R049 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AmfrQ9R049 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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