Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenooQ9DBC0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms