Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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