Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gdpd3Q99LY2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms