Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms