Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Alkbh6Q8K2U2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms