Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms