Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccser1Q8C0C4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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