Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmeff1Q6PFE7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.3 ms