Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms