Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms