Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tns3Q5SSZ5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tns3Q5SSZ5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tns3Q5SSZ5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tns3Q5SSZ5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tns3Q5SSZ5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tns3Q5SSZ5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tns3Q5SSZ5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tns3Q5SSZ5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tns3Q5SSZ5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms