Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Snx27Q3UHD6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx27Q3UHD6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Snx27Q3UHD6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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